日本的植物种类繁多。在日本本土生长着约5560种植物(4720种被子植物,40种裸子植物,800种蕨类植物)。约有1950种被子植物和裸子植物为日本本土原生植物,约占日本所有被子植物和裸子植物的35%。约有1600种被子植物和高裸子植物为日本当地的原生植物。截止到2011年11月,共有超过6万种生物在日本生息。但是,日本森林资源丰富,森林覆盖率占日本陆地面积的69%,是世界上森林覆盖率最高的国家之一。
[11]渔业资源丰富北海道和日本海是世界着名的大渔场,盛产700多种鱼类。
[12]日本自然资源贫乏,除煤炭、天然气、硫磺等极少量矿产资源外,其他工业生产所需的主要原料、燃料等都要从海外进口。
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