跨境出口电商物流模式主要有两种：国际物流模式和海外仓模式。国际物流模式即由物流企业将货物从国内直接运送到国外，配送到客户手中，依据承运商不同，目前国际物流方式主要有5种：邮政小包、国际快递、专线物流、海外仓和国内快递企业的跨国物流业务。其中，邮政小包和国际快递是最简单、最直接的物流方式，也是目前使用最多的物流方式，尤其是对于众多中小外贸企业。
邮政方式覆盖地区范围广，在业务价格上相对国际快递有绝对优势，同国内集货与海外仓相比，邮政小包具有使用便捷的优势。但是丢包率高，时效慢且不稳定，旺季往往需要30天以上。并且一般以私人包裹方式出境，不便于海关统计，也无法享受正常的出口退税。
国际快递以联邦快递(FedEx)、联合包裹(UPS)、敦豪速递(DHL)、天地快运(TNT)等四大国际快递公司最为知名。国际快递方式与邮政方式相反，价格昂贵但时效快、服务好、丢包率低，尤其是发往欧美发达国家非常方便。一般国内商家只有在客户时效性要求很强的情况下，才使用商业快递来派送商品，且会向客户收取运费。
专线物流往往采用航空包舱方式运输到国外，再通过合作公司进行目的国派送，能够通过专线的规模效应降低成本，业内使用最普遍的物流专线包括美国专线、欧洲专线、澳洲专线、俄罗斯专线等，也有不少物流公司推出了中东专线、南美专线。EMS的“国际E邮宝”、中环运的“俄邮宝”和“澳邮宝”、俄速通的Ruston中俄专线都属于跨境专线物流推出的特定产品。专线物流价格比商业快递低，速度快于邮政小包，丢包率也比较低，但在国内的揽收范围相对有限，覆盖地区有待扩大。
国内快递主要指EMS、顺丰和“四通一达”。近几年国内快递企业加速跨境业务布局，“四通一达”中申通、圆通布局较早，比如美国申通2014年3月才上线，圆通也是2014年4月才与CJ大韩通运展开合作，而中通、汇通、韵达也是近年来才启动跨境物流业务。顺丰的国际化业务则要成熟些，开通了多个国家的快递业务，发往亚洲国家的快件一般2-3天可以送达，并启动了中国大陆往俄罗斯的跨境B2C服务。国内快递跨国业务速度较快，费用低于四大国际快递巨头，EMS在中国境内的出关能力强，但由于并非专注跨境业务，相对缺乏经验，对市场的把控能力有待提高，覆盖的海外市场也比较有限。
海外仓模式是指由网络外贸交易平台、物流服务商独立或共同为卖家在销售目标地提供的货品仓储、分拣、包装、派送的一站式控制与管理服务，包括头程运输、海外仓储和终端配送三个环节。海外仓模式可以解决时效、成本、清关及本土化等问题，基本模式是中国出口企业批量将货物出口，储存在海外仓库，待顾客下单后，再在当地进行分拣、包装、配送。海外仓模式降低了物流成本、提供售后服务、提高用户满意度，还可以拓展销售品类，但可能由于预判不准确，容易造成海外仓库存积压。目前，跨境出口电商的海外仓模式有三种方式:自建或租用仓、亚马逊FBA仓和第三方仓库。
海外仓发展迅速，成为跨境出口新常态。近年来，从国务院到各个部委，再到各地方政府，都密集出台了扶持和规范跨境电商发展的政策措施，而对海外仓的扶持也多有体现。各地政府部门皆出台了不同程度建设、发展海外仓的举措，帮助国内企业更好的“出海”。在国际贸易持续增长，跨境电商持续升温的情况下，尤其是在季节性高峰的冲击之下，海外仓迎来了前所未有的机遇。很多中国买家把东西放在海外售卖，因此很多供应商进入了海外仓的行列，但是从海外仓的发展来说，它的端到端的复杂流程，需要投入大量的人力和物力，还有知识产权、管理系统等方面进行管理。
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