1542年:葡萄牙人随明船漂流至种子岛。铁炮的传入。
1550年:葡萄牙船第一次进港平户。
1552年:葡萄牙传教士阿鲁梅达(Luís de Almeida)来日。
1561年:平户发生宫前事件。
1562年:葡萄牙船离开平户,大村纯忠应葡萄牙人的要求将横瀬浦开港。有马义贞(大村纯忠之兄)将口之津作为贸易港开港。
1563年:7月6日3艘葡萄牙船进港横濑浦。葡萄牙传教士弗洛伊斯来日。横瀬浦被后藤贵明(纯忠的义弟)袭击、烧毁。
1564年:葡萄牙船自横濑浦返回平户。
1565年:葡萄牙船离开平户前往大村领的福田港。福田港开港。
1570年:大村纯忠同意长崎开港。
1575年:长筱之战,铁炮队的威力发挥。
1576年:京都南蛮寺建立。
1580年:大村纯忠将领地内的长崎献给耶稣会。
1582年:天正遣欧少年使节从长崎港起航。
1585年:遣欧使节谒见罗马教皇。
1589年:丰臣秀吉取缔耶苏教、放逐宣教师至长崎、京都南蛮寺烧毁。
1590年:7月21日天正遣欧少年使节归来长崎。
1596年:西班牙船圣·菲力号(San Felipe)漂流至土佐浦户(圣·菲力号事件)。
1597年:日本二十六圣人殉教。
1598年:丰臣秀吉病殁。
1600年:关原合战。荷兰船Liefde号漂至丰后。英国人威廉·亚当斯来日。
1605年:长崎成为幕府的直辖地(天领)。
1609年:2艘荷兰船进港平户。平户设置荷兰商馆。西班牙船圣法兰西斯可号(San Francisco)遇上台风漂流至上总。
1610年:1月葡萄牙船Madre de Deus号在长崎被有马晴信攻击沉没。德川家康派遣京都商人田中胜介到新西班牙。
1612年:冈本大八事件、9月幕府发布天主教禁教令。
1613年:伊达政宗派遣家臣支仓常长前往罗马。从奥州月之浦(今石卷市)出帆。英国船第一次进港平户。平戸设置英国商馆。
1615年:支仓常长谒见罗马教皇。
1616年:6月1日德川家康病殁。9月18日幕府禁止基督教,限定唐船以外的外国船只能到平戸、长崎。
1620年:9月22日支仓常长经马尼拉回国。
1622年:元和大殉教。
1623年:平户英国商馆关闭。
1624年:禁止西班牙船来航。
1628年:7月幕府关闭平户荷兰商馆、船扣留(滨田弥兵卫事件),来航的葡萄牙船也被扣留。
1632年:日荷贸易恢复。
1634年:德川家光命令在长崎出岛筑造葡萄牙人收容所。
1635年:7月幕府发布锁国令,禁止日本人出入国。限制唐船只能到长崎。
1636年:长崎出岛完成。强制收容葡萄牙人家族。10月德川家光放逐287个混血儿到澳门。
1637年:爆发岛原之乱。
1638年:岛原之乱平定。
1639年:禁止葡萄牙船来航。英国、荷兰人的妻子遭放逐到巴达维亚。
1641年:平户荷兰商馆转移到长崎出岛。